Гуситское движение a 15 век
Существовавший пресбитерий был продолжен трехнефной пристройкой. Таким образом общая длина церкви достигла 110 метров. Ближе всего к завершению приблизилось строительство северного бокового нефа, который, по-видимому, был докончен. До настоящего времени, однако, лучше сохранилась стена южного нефа с готическими окнами, которую можно видеть на чердаке монастыря. На северной стороне, по направлению к Старому Городу, очевидно в 1405 году была достроена «высокая красивая башня». В ней был помещен большой колокол, получивший название «Карел» или «неутомимый». На южной стороне начали строить соответствующую ей другую башню, но почти сразу же от проекта отказались.
Вскоре началось гуситское движение, и строительство прекратилось. Уже в 1412 году монастырь подвергся нападению и разграблению, в котором принимал активное участие последователь Яна Гуса Иероним Пражский. В источниках того времени иеется запись о том, что «в монастыре Девы Марии на Песке (другое название Девы Марии Снежной) в Праге он вынул из алтаря реликвии, бросил их в грязь и топтал». Волнения снова вспыхнули в 1415 году. В езультате этого Король Вацлав IV 25 января 1419 года позволил гуситам в церкви Девы Марии Снежной, равно как и в других двух церквях недалеко от границы между Старым и Новым Городом, осуществлять богослужбы, проповедовать, петь чешские песни и причащаться вином и просвирой. Церковь св. Бенедикта (одна из упоминавшихся церквей) была вскоре возвращена католикам В результате этих событий церковь Девы Марии Снежной стала центром наиболее радикально настроенных гуситов во главе с ярым проповедником Яном Желивским.
В напряженное время – в воскресенье, 30 июля1419 года – в Новом Городе должен был состояться крестный ход. После пламенной проповеди Желивский, взяв в руку дарохранительницу, повел шествие к церкви св. Стефана. К церкви Девы Марии Снежной возвращались через Новоместский рынок около ратуши. Здесь произошло столкновение гуситов с членами магистрата, завершившееся штурмом ратуши и ее взятием. Схваченные чиновники были выброшены из окон на площадь и убиты. Это событие, вошедшее в историю под названием «Первая пражская дефенестрация», положило начало тяжелому периоду гуситских войн в Чехии.
После смерти короля Вацлава IV (16 августа 1419) началось массовое разграбление пражских церквей и монастырей. На монастырь Девы Марии Снежной, 20 августа было совершено нападение, и некоторые монахи были взяты в плен. Подробных данных об ущербе, нанесенном монастырю в результате грабежей, мы не имеем, но во всяком случае это означало окончательный конец строительства нефа. Опустевший монастырь находился под управлением муниципалитета Нового Города пражского.
Слишком радикальный Ян Желивский, казненный 9 марта 1422 года на Староместской площади, был похоронен в церкви Девы Марии Снежной под тогдашней кафедрой.
В 1434 году между Старым и Новым Городом вспыхнула гражданская война, окончившаяся победой староместской стороны. В этих боях важную роль играла северная «высокая прекрасная башня», представлявшая собой стратегическую точку для обстрела Старого Города. С башни Новоместские били в большой колокол тревогу. Поэтому башня стала целью обстрела для Староместских, в результате которого был сбит колокол, а при последующей атаке была разрушена и вся башня.
После того как монастырь был приведен в порядок, кармелиты в меньшем количестве в 1436 году смогли вернуться сюда. Однако во время эпидемии чумы, вспыхнувшей в период правления Владислава II, в сентябре 1483 года начались новые волнения, и кармелиты снова бежали из Праги. Во время этих волнений толпа отбила головы на рельефе над монастырскими воротами. В 1496 году кармелиты снова вернулись в монастырь, но и на этот раз это был период неспокойный и неустойчивый. Продолжать строительство было невозможно.